S’il y a un Dieu, alors toute explication significative de choses significatives serait logiquement tenue de prendre ce fait en compte.
Bien sûr, les choses ne sont pas parfaites, de sorte que la plupart des explications doivent également traiter de la manière dont un monde corrompu pourrait avoir compliqué la situation idéale. (En prenant en compte le péché originel, dans la théologie chrétienne, par exemple.)
La pensée logique est toujours nécessaire, car le monde dans lequel nous vivons semble nécessiter une logique de compréhension. Cela semble être intégré à la nature de l’univers. (Aussi appelé création, d’ailleurs).
Il n’y a aucune raison pour que l’univers doive être logique, soit dit en passant. Ce pourrait être juste le chaos, le désordre et inexplicable. Mais il y a un ordre et une logique innés dans l’univers, et c’est pourquoi et comment les mathématiques et la physique sont utiles.
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Vous pouvez théoriser que dans le récit biblique de la création, il pourrait y avoir eu un “moment” où le chaos était la règle plutôt que l’ordre. Considérez les mots “formless and void” dans la traduction anglaise du récit biblique.
Mais peut-être que la raison même de l’ordre et de la raison d’exister est que Dieu a construit ces choses dans l’univers. S’il y a un Dieu, alors toutes choses, y compris l’ordre et la raison, lui sont soumises, et non l’inverse. (Je ne dis pas que Dieu est illogique et déraisonnable, bien au contraire.)
Votre question se résume donc à “Existe-t-il un Dieu qui a créé l’univers et qui a choisi de le rendre tel qu’il est?” Et il est nécessaire d’utiliser la logique et la raison pour essayer de comprendre le fonctionnement de cet univers.